Kot je že bilo omenjeno, oralna kirurgija, med ostalim, vključuje puljenje poškodovanega zoba ali korenine, ki ju ni mogoče pozdraviti. Če zoba ne moremo pozdraviti z endodontskim zdravljenjem, skušamo zob rešiti oziroma se izogniti puljenju s kirurškim posegom, imenovanim apikotomija, pri čemer kirurško odstranimo apikalno tretjino korenine (vrh korenine) le, če to ni mogoče, potem je puljenje zoba zadnji poseg v terapiji nekaterih bolezni.

Na drugi strani sta tudi kirurška posega, ki se uporabljata pred vgradnjo implantatov, in sicer ko je potrebno nadomestiti kost: dvig sinusnega dna in regeneracija kosti.

Pri določenih ortodontskih posegih ali težavah pri zobljenju prav tako lahko posegamo po kirurškem posegu kot je kortikotomija.

Oralna kirurgija vključuje tudi posege na mehkem tkivu kot je odstranitev cist ali oralnofacialna korekcija.